MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013124	CCAG	3	12	110474	110485	25 %	0 %	25 %	50 %	256370922
2502	NC_013124	GAGC	2	8	110494	110501	25 %	0 %	50 %	25 %	256370922
2503	NC_013124	GC	3	6	110515	110520	0 %	0 %	50 %	50 %	256370922
2504	NC_013124	GTG	2	6	110540	110545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370922
2505	NC_013124	CGA	2	6	110547	110552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2506	NC_013124	AGC	2	6	110573	110578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2507	NC_013124	TCG	2	6	110584	110589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2508	NC_013124	CGTG	2	8	110598	110605	0 %	25 %	50 %	25 %	256370922
2509	NC_013124	CAG	2	6	110623	110628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2510	NC_013124	ACC	2	6	110671	110676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370922
2511	NC_013124	CGG	2	6	110708	110713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370922
2512	NC_013124	CGA	2	6	110826	110831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2513	NC_013124	CTC	2	6	110866	110871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370922
2514	NC_013124	GTG	2	6	110908	110913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370922
2515	NC_013124	TCG	2	6	110966	110971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2516	NC_013124	TCG	2	6	110975	110980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2517	NC_013124	GCC	2	6	111000	111005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370922
2518	NC_013124	TCG	3	9	111011	111019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2519	NC_013124	CGT	2	6	111038	111043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2520	NC_013124	CGA	2	6	111066	111071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2521	NC_013124	CGA	2	6	111084	111089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2522	NC_013124	GCA	2	6	111176	111181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370922
2523	NC_013124	GAG	2	6	111243	111248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370923
2524	NC_013124	CGGCC	2	10	111314	111323	0 %	0 %	40 %	60 %	256370923
2525	NC_013124	GC	3	6	111408	111413	0 %	0 %	50 %	50 %	256370923
2526	NC_013124	CGA	2	6	111425	111430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370923
2527	NC_013124	TCG	3	9	111457	111465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370923
2528	NC_013124	CGG	2	6	111530	111535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370923
2529	NC_013124	TGA	2	6	111566	111571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370923
2530	NC_013124	CGGC	2	8	111581	111588	0 %	0 %	50 %	50 %	256370923
2531	NC_013124	TCGC	2	8	111592	111599	0 %	25 %	25 %	50 %	256370923
2532	NC_013124	GCCGA	2	10	111606	111615	20 %	0 %	40 %	40 %	256370923
2533	NC_013124	GAG	2	6	111618	111623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370923
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2536	NC_013124	CGG	2	6	111734	111739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370923
2537	NC_013124	CGA	2	6	111755	111760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370923
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2539	NC_013124	CGA	2	6	111800	111805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370923
2540	NC_013124	GCCGC	2	10	111812	111821	0 %	0 %	40 %	60 %	256370923
2541	NC_013124	AGTC	2	8	111823	111830	25 %	25 %	25 %	25 %	256370923
2542	NC_013124	TTC	2	6	111843	111848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370924
2543	NC_013124	CGT	2	6	111900	111905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370924
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2545	NC_013124	CGG	2	6	111919	111924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370924
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2550	NC_013124	TGAA	2	8	112078	112085	50 %	25 %	25 %	0 %	256370924
2551	NC_013124	CCT	2	6	112109	112114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370924
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2556	NC_013124	GC	3	6	112285	112290	0 %	0 %	50 %	50 %	256370925
2557	NC_013124	GTGC	2	8	112322	112329	0 %	25 %	50 %	25 %	256370925
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2559	NC_013124	CCT	2	6	112431	112436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370925
2560	NC_013124	GCC	2	6	112618	112623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370925
2561	NC_013124	GACG	2	8	112639	112646	25 %	0 %	50 %	25 %	256370925
2562	NC_013124	CG	3	6	112657	112662	0 %	0 %	50 %	50 %	256370925
2563	NC_013124	GTC	3	9	112753	112761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370925
2564	NC_013124	CGAT	2	8	112790	112797	25 %	25 %	25 %	25 %	256370925
2565	NC_013124	AGC	2	6	112823	112828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370925
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2570	NC_013124	GCC	2	6	113015	113020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370925
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2572	NC_013124	GCT	2	6	113121	113126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370925
2573	NC_013124	GTC	2	6	113143	113148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370925
2574	NC_013124	GTC	2	6	113167	113172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370925
2575	NC_013124	GCG	2	6	113215	113220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370925
2576	NC_013124	TCCGA	2	10	113258	113267	20 %	20 %	20 %	40 %	256370925
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2580	NC_013124	CGC	2	6	113560	113565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370925
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2586	NC_013124	CGAG	2	8	113878	113885	25 %	0 %	50 %	25 %	256370926
2587	NC_013124	CG	3	6	113959	113964	0 %	0 %	50 %	50 %	256370926
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2592	NC_013124	GTG	2	6	114092	114097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370926
2593	NC_013124	GCGG	2	8	114098	114105	0 %	0 %	75 %	25 %	256370926
2594	NC_013124	GC	3	6	114144	114149	0 %	0 %	50 %	50 %	256370926
2595	NC_013124	ACG	2	6	114198	114203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370926
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2600	NC_013124	AGG	2	6	114339	114344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370926
2601	NC_013124	CGA	2	6	114355	114360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2602	NC_013124	CGAGG	2	10	114389	114398	20 %	0 %	60 %	20 %	256370926
2603	NC_013124	GAC	2	6	114413	114418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2604	NC_013124	TCG	2	6	114537	114542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2605	NC_013124	GAG	2	6	114554	114559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370926
2606	NC_013124	GA	3	6	114588	114593	50 %	0 %	50 %	0 %	256370926
2607	NC_013124	CGT	2	6	114627	114632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2608	NC_013124	TGC	2	6	114633	114638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2609	NC_013124	TGC	2	6	114661	114666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2610	NC_013124	TCG	2	6	114705	114710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370926
2611	NC_013124	CGC	2	6	114727	114732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370926
2612	NC_013124	CG	3	6	114772	114777	0 %	0 %	50 %	50 %	256370926
2613	NC_013124	GCTC	2	8	114846	114853	0 %	25 %	25 %	50 %	256370926
2614	NC_013124	CGT	3	9	114866	114874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370926
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2621	NC_013124	GCC	2	6	115224	115229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370927
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2623	NC_013124	GTC	2	6	115306	115311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370927
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2742	NC_013124	GTC	2	6	121310	121315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370930
2743	NC_013124	GGT	2	6	121367	121372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370930
2744	NC_013124	CGGCT	2	10	121398	121407	0 %	20 %	40 %	40 %	256370930
2745	NC_013124	CCG	2	6	121455	121460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370930
2746	NC_013124	CG	5	10	121476	121485	0 %	0 %	50 %	50 %	256370930
2747	NC_013124	GAG	2	6	121508	121513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370930
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2753	NC_013124	GCC	2	6	121742	121747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370930
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2755	NC_013124	TGC	3	9	121882	121890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370930
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2850	NC_013124	GC	3	6	126589	126594	0 %	0 %	50 %	50 %	256370933
2851	NC_013124	TGC	2	6	126623	126628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370933
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2854	NC_013124	GCTCG	2	10	126711	126720	0 %	20 %	40 %	40 %	256370933
2855	NC_013124	TGG	2	6	126919	126924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370934
2856	NC_013124	GCGTTG	2	12	126993	127004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256370934
2857	NC_013124	CGC	2	6	127040	127045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370934
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2859	NC_013124	TGAG	2	8	127190	127197	25 %	25 %	50 %	0 %	256370934
2860	NC_013124	GAG	2	6	127210	127215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370935
2861	NC_013124	CG	4	8	127242	127249	0 %	0 %	50 %	50 %	256370935
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2863	NC_013124	TCG	2	6	127392	127397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370935
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2975	NC_013124	CG	3	6	133584	133589	0 %	0 %	50 %	50 %	256370939
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2982	NC_013124	GCC	2	6	133996	134001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370940
2983	NC_013124	CCAT	2	8	134026	134033	25 %	25 %	0 %	50 %	256370940
2984	NC_013124	GGC	2	6	134143	134148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370940
2985	NC_013124	GAC	2	6	134184	134189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370940
2986	NC_013124	GCT	2	6	134267	134272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370940
2987	NC_013124	GCC	2	6	134297	134302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370940
2988	NC_013124	GCG	2	6	134376	134381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370940
2989	NC_013124	GCC	3	9	134400	134408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370940
2990	NC_013124	GCA	2	6	134412	134417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370940
2991	NC_013124	CTT	2	6	134459	134464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370940
2992	NC_013124	GCG	2	6	134467	134472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370940
2993	NC_013124	TGT	2	6	134485	134490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256370940
2994	NC_013124	CGA	2	6	134603	134608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370940
2995	NC_013124	TGACG	2	10	134609	134618	20 %	20 %	40 %	20 %	256370940
2996	NC_013124	GC	3	6	134622	134627	0 %	0 %	50 %	50 %	256370940
2997	NC_013124	GCC	2	6	134678	134683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370940
2998	NC_013124	GCT	2	6	134714	134719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370940
2999	NC_013124	CAA	2	6	134723	134728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256370940
3000	NC_013124	TCA	2	6	134800	134805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370940

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